মস্তিষ্কমূল
ইংরেজি: brainstem

মস্তিষ্কের এই অংশটুকু রয়েছে একবারের করোটির নিচের দিকে। মস্তিষ্কের এই অংশটির সাথে সুষুম্নাকাণ্ড (Spinal Cord) যুক্ত থাকে। সুষুম্নাকাণ্ড দ্বারা বাহিত সকল তথ্য মস্তিষ্ক এই অংশ দ্বারা গ্রহণ করে। এছাড়া শ্বাস-প্রশ্বাস, হৃদপিণ্ডের গতি, রক্তের চাপ ইত্যাদি এই অংশ দ্বারা নিয়ন্ত্রিত হয়।

এর অপর নাম সরীসৃপীয় মস্তিষ্ক (
reptilian brain)। বিজ্ঞানীরা মনে করেন, ৩৪ কোটি বৎসর আগে (কার্বনিফোরাস) অধিযুগে- টেট্রাপোডদের একটি দল বিবর্তিত হয়ে সরীসৃপ শ্রেণীর প্রাণীতে পরিণত হয়েছিল। আর  কার্বোনিফোরাস অধিযুগের শেষের দিকে, ৩০ কোটি বৎসর আগে- সরীসৃপ শ্রেণীর প্রাণীকূল বিভিন্ন বৈশিষ্ট্যে বিভক্ত হয়ে পড়েছিল। আদি সরীসৃপ জাতীয় প্রাণীদেহে প্রথম মস্তিষ্কের এই অংশের বিকাশ ঘটেছিল। সরীসৃপ থেকে বিবর্তিত হয়ে যত প্রাণী রয়েছে, তাদের ভিতর মস্তিষ্কের এই অংশ রয়েছে। এই অংশে রয়েছে ক্ষুধা, ভয় জাতীয় অনুভুতি।

কার্যক্রমের বিচারে একে তিনটি ভাগে ভাগ করা হয়। এই ভাগগুলো হলো
 পশ্চাৎ মস্তিষ্ক, মধ্য মস্তিষ্ক এবং ডায়েনসেফালন।